जबकि कुछ शोध सामान्य आबादी (4 – 5% बनाम 3%) की तुलना में आईवीएफ-गर्भित बच्चों में जन्म दोषों की थोड़ी अधिक घटनाओं का सुझाव देते हैं, यह संभव है कि यह दोष आईवीएफ उपचार के अलावा अन्य कारकों के कारण हो।

यह जानना महत्वपूर्ण है कि सामान्य जनसंख्या में जन्म दोषों की दर प्रमुख विकृतियों के लिए सभी जन्मों का लगभग 3% है और यदि मामूली दोष शामिल हैं तो 6% है। हाल के अध्ययनों से पता चला है कि आईवीएफ-गर्भित बच्चों में प्रमुख जन्म दोषों की दर 4 से 5% के क्रम में हो सकती है। आईयूआई के बाद पैदा हुए बच्चों और आईवीएफ बच्चों के स्वाभाविक रूप से गर्भ धारण करने वाले भाई-बहनों के लिए दोषों की यह थोड़ी बढ़ी हुई दर भी बताई गई है, इस प्रकार यह संभव है कि गर्भधारण करने के लिए इस्तेमाल की जाने वाली तकनीक के बजाय इस विशेष रोगी आबादी में जोखिम कारक निहित है

अनुसंधान दर्शाता है कि आईवीएफ-गर्भित बच्चे शैक्षणिक उपलब्धि के साथ-साथ व्यवहार और मनोवैज्ञानिक स्वास्थ्य के मामले में सामान्य आबादी के बराबर हैं। इस महत्वपूर्ण मुद्दे की और जांच करने के लिए और अधिक अध्ययन किए जा रहे हैं।